Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms