Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD3Q9NYL9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
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