Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms