Protein–RNA interactions for Protein: Q99217

AMELX, Amelogenin, X isoform, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMELXQ99217 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMELXQ99217 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms