Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUDCD1Q96RS6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDCD1Q96RS6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms