Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACAP3Q96P50 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACAP3Q96P50 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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