Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPOR3Q96MK2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPOR3Q96MK2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms