Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SIRT1Q96EB6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms