Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKAP2LQ8IYA6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP2LQ8IYA6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms