Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J8

UBE3D, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3DQ7Z6J8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBE3DQ7Z6J8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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UBE3DQ7Z6J8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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UBE3DQ7Z6J8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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UBE3DQ7Z6J8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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UBE3DQ7Z6J8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE3DQ7Z6J8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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