Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L3Q6VB84 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD4L3Q6VB84 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L3Q6VB84 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms