Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF4Q2M2E3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms