Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
R3HDM1Q15032 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
R3HDM1Q15032 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
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