Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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