Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIGQ13278 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIGQ13278 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIGQ13278 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIGQ13278 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIGQ13278 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIGQ13278 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIGQ13278 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIGQ13278 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIGQ13278 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIGQ13278 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIGQ13278 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIGQ13278 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIGQ13278 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIGQ13278 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIGQ13278 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIGQ13278 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIGQ13278 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RIGQ13278 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RIGQ13278 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIGQ13278 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIGQ13278 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIGQ13278 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIGQ13278 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIGQ13278 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIGQ13278 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIGQ13278 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIGQ13278 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIGQ13278 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIGQ13278 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIGQ13278 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIGQ13278 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIGQ13278 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIGQ13278 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIGQ13278 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIGQ13278 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIGQ13278 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIGQ13278 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIGQ13278 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIGQ13278 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIGQ13278 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIGQ13278 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIGQ13278 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms