Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SREBF2Q12772 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SREBF2Q12772 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
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