Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL6Q02878 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms