Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF2Q01130 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF2Q01130 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF2Q01130 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms