Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRP55822 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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