Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIF1P55008 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIF1P55008 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIF1P55008 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIF1P55008 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIF1P55008 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIF1P55008 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIF1P55008 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIF1P55008 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIF1P55008 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIF1P55008 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIF1P55008 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIF1P55008 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIF1P55008 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIF1P55008 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIF1P55008 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIF1P55008 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIF1P55008 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AIF1P55008 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIF1P55008 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIF1P55008 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIF1P55008 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIF1P55008 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIF1P55008 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIF1P55008 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIF1P55008 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIF1P55008 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIF1P55008 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AIF1P55008 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AIF1P55008 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AIF1P55008 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIF1P55008 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIF1P55008 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIF1P55008 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIF1P55008 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIF1P55008 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIF1P55008 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIF1P55008 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIF1P55008 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIF1P55008 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIF1P55008 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIF1P55008 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIF1P55008 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIF1P55008 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIF1P55008 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIF1P55008 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIF1P55008 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIF1P55008 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AIF1P55008 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIF1P55008 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIF1P55008 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIF1P55008 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIF1P55008 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIF1P55008 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIF1P55008 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIF1P55008 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIF1P55008 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AIF1P55008 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AIF1P55008 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIF1P55008 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIF1P55008 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIF1P55008 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIF1P55008 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIF1P55008 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AIF1P55008 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIF1P55008 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIF1P55008 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIF1P55008 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIF1P55008 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIF1P55008 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIF1P55008 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIF1P55008 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIF1P55008 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIF1P55008 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIF1P55008 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIF1P55008 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIF1P55008 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIF1P55008 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIF1P55008 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIF1P55008 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIF1P55008 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIF1P55008 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIF1P55008 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIF1P55008 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIF1P55008 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIF1P55008 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIF1P55008 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIF1P55008 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIF1P55008 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms