Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT3P45378 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT3P45378 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms