Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRMP19623 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRMP19623 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRMP19623 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRMP19623 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRMP19623 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRMP19623 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRMP19623 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRMP19623 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRMP19623 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRMP19623 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRMP19623 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRMP19623 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRMP19623 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRMP19623 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRMP19623 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRMP19623 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRMP19623 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRMP19623 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRMP19623 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRMP19623 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRMP19623 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRMP19623 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRMP19623 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRMP19623 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRMP19623 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRMP19623 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRMP19623 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRMP19623 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRMP19623 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRMP19623 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRMP19623 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRMP19623 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRMP19623 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRMP19623 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRMP19623 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRMP19623 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRMP19623 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRMP19623 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRMP19623 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRMP19623 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRMP19623 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRMP19623 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRMP19623 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRMP19623 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRMP19623 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRMP19623 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRMP19623 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRMP19623 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRMP19623 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRMP19623 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRMP19623 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRMP19623 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRMP19623 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRMP19623 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRMP19623 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRMP19623 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRMP19623 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRMP19623 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRMP19623 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRMP19623 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRMP19623 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRMP19623 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRMP19623 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRMP19623 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRMP19623 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRMP19623 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRMP19623 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRMP19623 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRMP19623 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRMP19623 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRMP19623 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms