Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DMDP11532 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DMDP11532 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DMDP11532 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DMDP11532 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DMDP11532 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DMDP11532 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DMDP11532 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DMDP11532 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DMDP11532 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DMDP11532 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DMDP11532 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DMDP11532 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DMDP11532 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DMDP11532 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DMDP11532 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DMDP11532 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DMDP11532 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DMDP11532 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DMDP11532 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DMDP11532 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DMDP11532 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DMDP11532 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DMDP11532 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DMDP11532 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DMDP11532 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DMDP11532 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DMDP11532 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DMDP11532 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DMDP11532 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DMDP11532 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DMDP11532 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DMDP11532 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DMDP11532 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DMDP11532 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DMDP11532 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DMDP11532 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DMDP11532 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DMDP11532 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DMDP11532 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DMDP11532 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DMDP11532 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DMDP11532 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DMDP11532 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DMDP11532 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DMDP11532 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DMDP11532 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DMDP11532 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DMDP11532 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DMDP11532 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DMDP11532 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DMDP11532 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DMDP11532 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DMDP11532 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DMDP11532 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DMDP11532 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DMDP11532 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DMDP11532 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DMDP11532 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DMDP11532 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DMDP11532 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DMDP11532 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DMDP11532 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DMDP11532 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DMDP11532 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DMDP11532 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DMDP11532 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DMDP11532 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DMDP11532 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DMDP11532 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DMDP11532 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DMDP11532 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DMDP11532 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DMDP11532 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DMDP11532 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DMDP11532 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DMDP11532 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DMDP11532 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DMDP11532 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DMDP11532 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DMDP11532 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DMDP11532 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DMDP11532 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DMDP11532 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DMDP11532 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DMDP11532 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DMDP11532 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DMDP11532 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DMDP11532 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DMDP11532 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DMDP11532 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DMDP11532 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DMDP11532 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DMDP11532 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DMDP11532 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DMDP11532 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DMDP11532 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DMDP11532 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DMDP11532 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DMDP11532 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms