Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TNP1P09430 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TNP1P09430 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TNP1P09430 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TNP1P09430 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TNP1P09430 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TNP1P09430 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TNP1P09430 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TNP1P09430 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TNP1P09430 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TNP1P09430 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms