Protein–RNA interactions for Protein: O14561

NDUFAB1, Acyl carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAB1O14561 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAB1O14561 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAB1O14561 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms