Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPA5E9PKD4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms