Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRN3P2A6NIE6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms