Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GYQ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GYQ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GYQ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GYQ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GYQ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GYQ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GYQ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GYQ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GYQ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GYQ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GYQ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GYQ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GYQ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GYQ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GYQ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GYQ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GYQ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GYQ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GYQ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GYQ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GYQ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GYQ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
V9GYQ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
V9GYQ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
V9GYQ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
V9GYQ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
V9GYQ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
V9GYQ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
V9GYQ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
V9GYQ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
V9GYQ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
V9GYQ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
V9GYQ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
V9GYQ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
V9GYQ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
V9GYQ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
V9GYQ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
V9GYQ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
V9GYQ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
V9GYQ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
V9GYQ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
V9GYQ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
V9GYQ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
V9GYQ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
V9GYQ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
V9GYQ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
V9GYQ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms