Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC27A6Q9Y2P4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A6Q9Y2P4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms