Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP2Q9P2J9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP2Q9P2J9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms