Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BSDC1Q9NW68 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BSDC1Q9NW68 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BSDC1Q9NW68 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms