Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM9

TRIM39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM39Q9HCM9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIM39Q9HCM9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM39Q9HCM9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM39Q9HCM9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM39Q9HCM9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM39Q9HCM9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms