Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOD2Q9HC29 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD2Q9HC29 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms