Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHMP4AQ9BY43 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP4AQ9BY43 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4AQ9BY43 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms