Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNG6Q9BXT2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNG6Q9BXT2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG6Q9BXT2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.8 ms