Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC106Q9BWC9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms