Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC136Q96JN2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms