Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCMH1Q96GD3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms