Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms