Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RCN3Q96D15 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms