Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPTQ96BT3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPTQ96BT3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPTQ96BT3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms