Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML1Q86YW5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms