Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMS2Q7Z4I7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIMS2Q7Z4I7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIMS2Q7Z4I7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms