Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHLDB3Q6NSJ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHLDB3Q6NSJ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms