Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC158Q5M9N0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC158Q5M9N0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms