Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS10Q3MIT2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS10Q3MIT2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS10Q3MIT2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS10Q3MIT2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS10Q3MIT2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS10Q3MIT2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS10Q3MIT2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS10Q3MIT2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS10Q3MIT2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS10Q3MIT2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS10Q3MIT2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS10Q3MIT2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 635.1 ms