Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1FQ16864 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms