Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTCH1Q13635 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTCH1Q13635 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PTCH1Q13635 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
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