Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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