Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED1Q13445 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED1Q13445 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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